Que raro que no te haya entrado entrado el conector de 24 pines, generalemte el conector de 24 pines viene separado de la forma 20+4, los cuales vienen juntos en la misma enrredadera de clables, como en la imagen
Asi que trata de fijarte en eso en el conector de 4pin y que encaje bien ya que encaja de una sola forma, ademas este conector de 4pin alimenta los requerimientos de los puertos pci-express, asi q es esencial que este conectado.
Ahora respecto al otro conector de 4pins que conectaste es el que le entrega energia al cpu, y es esencial osino no parte la placa, asi que todo bien. Ademas no te complicaras ya que estos conectores encajan de una sola forma a la placa, tal como te dije antes, por si piensas que tal vez te equivocaste.
Y en el caso del conector molex, es mejor que la vga este conectada directamente a la fuente, ese conector extra de la placa es de emergecnia cuando tengas todos los coenctores de fuente ocupados
saludos